Τίτλος:  Στοιχεία Γεωγραφίας / ερανισθέντα υπό του Αρχιεπισκόπου Νικηφόρου του Θεοτόκου πλείστοις δε Σημειώμασι και Σχήμασι πλουτισθέντα υπό Ανθίμου Γαζή ___. Επιστασία Ιωνά του εκ Μονής Κλήμεντος της εν Ολύμπω.
Συγγραφέας:  Θεοτόκης, Νικηφόρος,
Ημερομηνία έκδοσης:  1804.

Τίτλος:  Στοιχεία Φυσικής / Eκ νεωτέρων συνερανισθέντα υπό Νικηφόρου ιερομονάχου του Θεοτόκου. Εκδοθέντα Σπουδή τε και φιλοτίμω δαπάνη του Ελλογιμωτάτου και Εξοχωτάτου εν Ιατροφιλοσόφοις Θωμά Μανδακάσου, του εκ Καστοριάς. Διορθωθέντα δε υπό Αμβροσίου Ιερομονάχου, του Παμπέρεως.
Συγγραφέας:  Θεοτόκης, Νικηφόρος,
Ημερομηνία έκδοσης:  έτει αψξς-αψξζ.[=1766-1767].

Τίτλος:  Στοιχείων μαθηματικών εκ παλαιών και νεωτέρων / Συνερανισθέντων υπό του πανιερωτάτου Αρχιεπισκόπου πρώην Αστραχανίου κυρίου Νικηφόρου, Φιλοτίμω δε δαπάνη εκδοθέντων, Όπως δωρεάν διανέμωνται τοις εν τοις Ελληνομουσείοις Φοιτώσιν, υπό των τιμιωτάτων και φιλογενών αυταδέλφων Ζωσιμά.
Συγγραφέας:  Θεοτόκης, Νικηφόρος,
Ημερομηνία έκδοσης:  Έτει 1798-99.

Τίτλος:  Του μακαρίου Νικηφόρου του Θεοτόκου Πονήματα ιερά ανέκδοτα : Εκ χειρογράφου τεύχους της Εθνικής Βιβλιοθήκης / εκδίδοντος Ιωάννου Σακκελίωνος___.
Συγγραφέας:  Θεοτόκης, Νικηφόρος,
Ημερομηνία έκδοσης:  1890.