Τίτλος:  Byzantinisch-Deutsche Beziehungen zur Zeit der Ottonen. / Von Dr. B. A. Mystakidis...
Συγγραφέας:  Μυστακίδης, Βασίλειος Αθ.,
Ημερομηνία έκδοσης:  1891.

Τίτλος:  Peregrinatio Hierosolymitana / Β. Α. Μυστακίδου.
Συγγραφέας:  Μυστακίδης, Βασίλειος Αθ.,
Ημερομηνία έκδοσης:  1923.

Τίτλος:  Αι ετερόδοξοι κοινότητες εν Συρία και τα εν αυταίς σχολεία : Επιστολιμαία διατριβή τω σεβασμιωτάτω της των Αγχιαλιτών εκκλησίας ιεράρχη Βασιλείω / Β. Α. Μυστακίδου.
Συγγραφέας:  Μυστακίδης, Βασίλειος Αθ.,
Ημερομηνία έκδοσης:  1897.

Τίτλος:  Αι Θρηνωδοί : Ήτοι η σαρκοφάγος των θρηνωδών εν τω Αυτοκρατορικώ Μουσείω / Β. Α. Μυστακίδου.
Συγγραφέας:  Μυστακίδης, Βασίλειος Αθ.,
Ημερομηνία έκδοσης:  1898.

Τίτλος:  Αι λέξεις Έλλην, Γραικός (Γραικύλος), Ρωμαίος (Γραικορρωμαίος), Βυζαντινός, Μωαμεθανός, Τούρκος.
Συγγραφέας:  Μυστακίδης, Βασίλειος Αθ.,
Ημερομηνία έκδοσης:  [1920;].

Τίτλος:  Ανέκδοτα εκ Τυβίγγης (Tübingen) [ανάτυπο] : Παχυμέρης Γεώργιος πρωτέκδικος και δικαιοφύλαξ Ζυγομάλας Θεοδόσιος Πρωτονοτάριος και δικαιοφύλαξ και Μάρτινος ο Κρούσιος / Β.Α. Μυστακίδου.
Συγγραφέας:  Μυστακίδης, Βασίλειος Αθ.,
Ημερομηνία έκδοσης:  1931.

Τίτλος:  Ανώτατα παιδευτήρια κατά τους βυζαντιακούς χρόνους και η παρά τα πατριαρχεία Μ. του Γένους Σχολή μετά την άλωσιν : λόγος εκφωνηθείς τη 30η Ιανουαρίου ε. ε. εορτή των Τριών Ιεραρχών εν τη μεγάλη αιθούση των Τελετών της Σχολής / υπό Β. Α. Μυστακίδου.
Συγγραφέας:  Μυστακίδης, Βασίλειος Αθ.,
Ημερομηνία έκδοσης:  1921.

Τίτλος:  Βιβλιογραφικά σπουδάσματα : Σημειώσεις, παρατηρήσεις, διορθώσεις- προσθήκαι τοις Μ. Vogel και Garthausen / Β. Α. Μυστακίδου.
Συγγραφέας:  Μυστακίδης, Βασίλειος Αθ.,
Ημερομηνία έκδοσης:  1924.

Τίτλος:  Βυζαντιακαί μελέται / Β. Α. Μυστακίδου.
Συγγραφέας:  Μυστακίδης, Βασίλειος Αθ.,

Τίτλος:  Γεωγραφικόν Εγχειρίδιον : Προς χρήσιν των Ελληνικών Σχολείων και Παρθεναγωγείων Μετά σχημάτων και εικόνων Κατά τα νεώτατα της επιστήμης πορίσματα εις δύο τεύχη / Β. Α. Μυστακίδου ...
Συγγραφέας:  Μυστακίδης, Βασίλειος Αθ.,
Ημερομηνία έκδοσης:  [1893]